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성능

측정된 분석 성능

BioSpark의 성능 수치는 워크로드, 데이터셋, 실행 기록과 함께 제시합니다. 현재 플랫폼의 벤치마크는 공개를 준비하고 있습니다. 공개되는 모든 수치에는 아래의 측정 기준과 조건을 함께 기록합니다.

측정 방법

성능 결과와 함께 기록하는 항목

성능 수치는 측정 조건과 함께 확인해야 합니다. BioSpark는 모든 벤치마크에 아래 7개 항목을 기록해, 무엇을 측정했는지 판단하고 같은 조건으로 비교할 수 있도록 합니다.

워크로드

사용자가 실행한 분석입니다. 예를 들어 전장유전체 Germline의 Complete 방식입니다.

실행한 분석
데이터셋

입력 샘플의 출처, 커버리지, 리드 길이입니다.

입력 데이터
분석 방식

Germline Complete, Germline Fast, Germline Accelerated 또는 Somatic입니다.

선택한 방식
실행 리소스

플랫폼에서 준비한 CPU 또는 GPU 중 실행에 사용한 컴퓨팅 유형입니다.

사용한 컴퓨팅
실행 시간

분석 시작부터 주요 결과를 사용할 수 있을 때까지의 실제 경과 시간입니다.

소요 시간
비용 산정 기준

실행에 사용한 리소스와 시간입니다. 기관별 비용 평가의 기준으로 사용할 수 있습니다.

리소스 사용량
측정일

실행한 날짜와 당시 플랫폼 버전입니다.

측정 시점
벤치마크

벤치마크 결과

현재 플랫폼에서 측정한 실행이 완료되면 공개된 결과를 이곳에서 확인할 수 있습니다.

표준 벤치마크 결과는 공개를 준비하고 있습니다. 현재 실행 가능한 Germline Complete, Germline Fast, Germline Accelerated(GPU), Somatic의 결과마다 워크로드, 데이터셋, 분석 방식, 실행 리소스, 실행 시간, 비용 산정 기준, 측정일을 명시합니다. 추정하거나 외삽한 수치는 공개하지 않습니다. 실행 기록으로 확인할 수 없는 기존 홍보 수치도 이 페이지에 사용하지 않습니다.

CPU와 GPU

분석 방식에 맞춰 사용하는 CPU와 GPU

Germline Complete, Germline Fast, Somatic은 CPU에서 실행합니다. Germline Accelerated는 GPU 가속 파이프라인을 사용하며 gVCF를 반환합니다. 플랫폼이 선택한 분석 방식에 맞는 컴퓨팅을 준비하고 실행 종료 후 해제하므로, 사용자가 클러스터 규모나 대기열을 관리할 필요가 없습니다.

CPU

Germline Complete · Germline Fast · Somatic

플랫폼 관리
GPU

Germline Accelerated

플랫폼 관리

연구 데이터로 성능을 확인하세요

연구에 가장 유용한 벤치마크는 직접 사용하는 샘플과 워크로드의 결과입니다. 연구 평가 과정에서 실행해 확인하세요.